目前治疗方法有两种：保守治疗和手术治疗。
　　a 、保守治疗：
　　祖国医学将卵巢囊肿归属于“癓瘕”范畴，认为此病的发生多由七情损伤、房事过劳，或经期、产后六淫外侵致使气机阻滞、脏腑失和、阴阳失衡而引起。因此，在治疗时，要针对其整体病因进行全面的、综合的分析，辩证施治，才能使疾病得以真正的解决。
　　由荣获2000年“共和国名医专家”陕西名医、“神圈刘”刘俊岺老中医在几十年临床应用中发明的“纯中药”制剂 “妇宝宁”，是以调整阴阳清宫排毒、祛除病因为基础的全新理论，在治疗卵巢囊肿方面取得了突破性进展，从根本上使囊肿进行充分吸收、缩小、最终完全消失，从而达到彻底康复的目的。
　　妇宝宁具有疗效好、见效快、疗程短、副作用小等特点，是目前治疗卵巢囊肿的首选药物。

b 、手术治疗：
　　 . 良性卵巢肿瘤患者，要切除患侧卵巢肿瘤，手术时一定要检查对侧的卵巢情况，如果对侧也有肿
　　　 瘤则必须切除，同时做病理检查。但术后易复发。
　　 . 恶性肿瘤者：手术是首选方法，其手术范围要广，一般都切除全子宫，双附件加大网膜。手术后
　　　 还须进行化疗、放疗。